En educación es arriesgado afirmar que un método está (o no) avalado por la ciencia. Existen distintos métodos pedagógicos y uno de ellos es el Montessori, el cual se aplica en diversos centros, especialmente en los concertados y privados.

Aquí un listado: https://ludus.org.es/es/projects?pedagogy_id=3&ownership=non-public

El método Montessori goza de buena reputación entre personas de talante alternativo. Un símil que considero adecuado para entender el abasto de la pregunta es: ¿la acupuntura la avala la ciencia? Existen detractores y personas que están muy contentas, lo mismo ocurre con el método Montessori.