Creo que es necesario una combinación de sentido común y buenas prácticas para darle cierto nivel de protección a los datos de Whatsapp.

En cuanto al sentido común es importante no envíar información y documentos confidenciales a través de chats de Whatsapp. También es importante no aceptar invitaciones o chats de personas desconocidas, confirmar que quien te contacta si es quien dice ser, evitar dar clic en enlaces que vienen dentro de las conversaciones (incluso de contactos conocidos) y procurar no reenviar cadenas de mensajes.

En cuanto a las buenas prácticas proteger/encriptar los archivos sensibles que se envién por este medio, activar la verificación de dos pasos, limitar los dispositivos vinculados. Es bueno recordar que Whatsapp ofrece el cifrado de extremo a extremo, lo cual ayuda a proteger la información, así como la función de mensajes temporales para eliminar los mensajes antiguos de forma automática,o las fotos y vídeos que se pueden ver una única vez.